Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms