Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms