Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcl1Q9JJT0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rcl1Q9JJT0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcl1Q9JJT0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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