Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJL0

Tsga8, Testis-specific gene A8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga8Q9JJL0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsga8Q9JJL0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsga8Q9JJL0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsga8Q9JJL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsga8Q9JJL0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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