Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem47Q9JJG6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem47Q9JJG6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms