Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6l2Q9JIM3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms