Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl1Q9JI74 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl1Q9JI74 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms