Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI43

Rhox4b, Homeobox protein EHOX, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4bQ9JI43 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox4bQ9JI43 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4bQ9JI43 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms