Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms