Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rb1cc1Q9ESK9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms