Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DysfQ9ESD7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms