Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3bQ9ES34 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms