Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms