Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfcp2Q9ERA0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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