Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r44Q9EQ47 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms