Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp1aQ9EPL5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp1aQ9EPL5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp1aQ9EPL5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp1aQ9EPL5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp1aQ9EPL5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp1aQ9EPL5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp1aQ9EPL5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp1aQ9EPL5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp1aQ9EPL5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms