Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn1Q9EPL2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms