Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufs3Q9DCT2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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