Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt112Q9DCG9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt112Q9DCG9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt112Q9DCG9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt112Q9DCG9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt112Q9DCG9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms