Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tysnd1Q9DBA6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms