Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms