Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms