Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samd8Q9DA37 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms