Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms