Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af1Q9D883 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms