Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms