Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp5Q9D7S9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms