Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms