Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4f1Q9D5Q6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms