Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms