Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms