Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam90a1bQ9D4F3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam90a1bQ9D4F3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms