Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc6Q9D4E6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc6Q9D4E6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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