Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UvssaQ9D479 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UvssaQ9D479 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms