Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacd2Q9D3B1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms