Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy3Q9D394 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy3Q9D394 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms