Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D2Q3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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