Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930583I09RikQ9D2E3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms