Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms