Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms