Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms