Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdca7Q9D0M2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms