Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nde1Q9CZA6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms