Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsfl1cQ9CZ44 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsfl1cQ9CZ44 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsfl1cQ9CZ44 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsfl1cQ9CZ44 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms