Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms