Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdm8Q9CXT6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms