Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms