Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms