Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pin4Q9CWW6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms