Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx28Q9CWT6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms